Лизин в корме для свиней и кур, глутамат натрия в приправах, витамин B12 в аптеке, лимонная кислота в газировке, пенициллин, ферменты в стиральном порошке — всё это производят микроорганизмы в огромных ферментёрах. Такое производство называют микробиологическим синтезом. Как заставить бактерию выделять в среду вещество, которое ей самой нужно в микроскопических количествах? Какие микроорганизмы что производят? Почему кормовой белок выгоднее выращивать в ферментёре, чем на поле? Это четвёртая статья серии «Биотехнология».
- 1. Что такое микробиологический синтез
- 2. Объекты микробиологических технологий
- 3. Как заставить клетку производить больше, чем ей нужно
- 4. Производство белка
- 5. Производство аминокислот
- 6. Производство витаминов
- 7. Органические кислоты и спирты
- 8. Антибиотики
- 9. Ферменты
- 10. Полисахариды и биополимеры
- 11. Рекомбинантные белки
- 12. Микробиологический и химический синтез: сравнение
- 13. Биотрансформация: микробы на службе химиков
- 14. Технологическая схема микробиологического синтеза
- 15. Как развивался микробиологический синтез
- 16. Откуда берутся штаммы-продуценты
- 17. Экономика процесса: из чего складывается цена
- 18. Микробиологический синтез и охрана природы
- 19. Пенициллин: как рождалась отрасль
- 20. Разбор примера: производство лизина
- 21. Как подбирают промышленный фермент
- 22. Словарь темы
- 23. Витамины: кто и как их получает
- 24. Закваски, пробиотики и биопрепараты
- 25. Генно-инженерные продуценты: что это меняет
- 26. Куда движется микробиологический синтез
- 27. Итог: что важно знать
- 28. Частые ошибки
- 29. Почему это важно знать
- 30. Интересные факты
- 31. Частые вопросы
- 32. ЕГЭ
- 33. Для олимпиад
- 34. Задания с разбором
- Литература
1. Что такое микробиологический синтез
Микробиологический синтез — промышленное получение веществ с помощью микроорганизмов: микроорганизм-продуцент, выращиваемый в контролируемых условиях, образует из относительно простых и дешёвых веществ среды сложное ценное соединение. Кодификатор называет «микробиологический синтез», «объекты микробиологических технологий» и «производство белка, аминокислот и витаминов» [1].
Важно отличать три типа процессов:
- Получение биомассы — нужны сами клетки: кормовые и пекарские дрожжи, белок микроорганизмов, закваски, бактериальные удобрения, пробиотики.
- Получение продуктов обмена (метаболитов) — клетки выделяют вещество в среду или накапливают его: аминокислоты, витамины, органические кислоты, антибиотики, ферменты, полисахариды.
- Биотрансформация — клетки или ферменты превращают готовое вещество, добавленное в среду, в другое, проводя одну-две реакции, трудных для химиков: например, превращение сорбита в сорбозу при синтезе витамина C или модификация стероидов при получении гормональных лекарств.
Почему не химический синтез
Многие продукты микробиологического синтеза можно получить и химически, но микробы выигрывают по нескольким причинам.
- Сложность молекул. Витамин B12 содержит более 180 атомов и ион кобальта; его химический синтез занял у группы Р. Вудворда и А. Эшенмозера около 12 лет и включает десятки стадий — промышленного значения он не имеет. Бактерии строят его сами.
- Нужная зеркальная форма. Аминокислоты белков существуют в двух зеркальных формах (L и D), а организм использует только L-формы. Химический синтез даёт смесь обеих форм, а бактерия синтезирует только L-форму.
- Мягкие условия и возобновляемое сырьё: сахар, крахмал, меласса вместо нефтехимии, высоких температур и давления.
- Масштабируемость: один штамм в одном ферментёре на сотни кубометров даёт тонны продукта в сутки.
Химия выигрывает, когда молекула проста и сырьё дёшево: метионин для кормов, например, в основном синтезируют химически, потому что животное усваивает и смесь форм этой аминокислоты.
2. Объекты микробиологических технологий
Объектами микробиологического синтеза служат бактерии и грибы, а в последние десятилетия — и генно-инженерные штаммы, получившие чужие гены.
| Продукт | Главные продуценты | Применение |
|---|---|---|
| Кормовой белок (биомасса) | дрожжи, метанокисляющие бактерии, микроводоросли, грибы | корм для скота, птицы, рыб; пищевые добавки |
| Глутаминовая кислота | коринебактерии | глутамат натрия — усилитель вкуса |
| Лизин, треонин, триптофан | коринебактерии, кишечная палочка | добавки к кормам, медицина |
| Витамин B12 | псевдомонады, пропионовокислые бактерии | лекарства, корма |
| Витамин B2 (рибофлавин) | гриб ашбия, сенная палочка | корма, пищевой краситель, лекарства |
| Витамин C (промежуточная стадия) | глюконобактерии и другие бактерии | лекарства, пищевая промышленность |
| β-Каротин | гриб блакеслея, водоросль дуналиелла | провитамин A, краситель |
| Лимонная кислота | аспергилл чёрный | напитки, кондитерские изделия, моющие средства |
| Молочная кислота | молочнокислые бактерии | пищевая промышленность, биоразлагаемый пластик |
| Антибиотики | пеницилл, цефалоспориум, стрептомицеты | медицина, ветеринария |
| Ферменты | бациллы, аспергиллы, триходерма, генно-инженерные штаммы | моющие средства, пищевая, текстильная, кормовая промышленность |
| Полисахариды (ксантан, декстран) | ксантомонады, лейконосток | загустители, кровезаменители |
| Рекомбинантные белки | генно-инженерные кишечная палочка, дрожжи | инсулин, гормон роста, интерфероны, вакцины |
Подробно о группах микроорганизмов и их свойствах рассказано во второй статье серии.
3. Как заставить клетку производить больше, чем ей нужно
Живая клетка экономна. Она синтезирует аминокислоту или витамин ровно в том количестве, которое нужно для роста, и не выделяет их в среду. Это обеспечивают механизмы регуляции, сложившиеся в ходе эволюции: перерасход ресурсов снижает приспособленность, и такие клетки проигрывают конкуренцию. Чтобы получить промышленного продуцента, эту экономию нужно сломать.
Механизмы, которые мешают перепроизводству
- Ингибирование по принципу обратной связи. Конечный продукт пути (например, аминокислота) присоединяется к первому ферменту пути и подавляет его активность. Как только аминокислоты достаточно, её синтез останавливается за секунды.
- Репрессия генов. Избыток конечного продукта выключает транскрипцию генов ферментов пути (как в триптофановом опероне кишечной палочки). Это более медленная, но экономная регуляция: клетка не тратит ресурсы на синтез ненужных ферментов.
- Распределение сырья между путями. Предшественник может идти на разные продукты; клетка направляет его туда, где он нужнее.
- Отсутствие выброса. Нужное клетке вещество удерживается внутри; переносчики, выводящие его из клетки, работают слабо.
Как получают продуцентов
Продуцентов получают селекцией: отбирают штаммы, у которых нормальная регуляция пути ослаблена и продукт выделяется в среду, а затем улучшают их методами генетики и генной инженерии с опорой на прочитанный геном [2]. Первые продуценты глутаминовой кислоты открыл С. Киносита [3].
Что даёт знание генома продуцента
Когда в 2003 г. была прочитана полная последовательность генома коринебактерии [2], стало возможно сравнивать геномы промышленных штаммов с исходным природным и видеть, какие именно изменения накопились за десятилетия селекции. Оказалось, что у «рекордсменов» изменены не один-два гена, а десятки: ферменты путей синтеза, переносчики, гены центрального обмена, регуляторы. Многие из этих изменений селекционеры получили вслепую, не зная, что именно они меняют.
Это дало новый приём: полезные изменения можно переносить в «чистый» природный штамм по одному, собирая продуцента заново — без груза случайных мутаций, снижающих жизнеспособность. Такой штамм растёт быстрее, стабильнее и лучше переносит промышленные условия.
Главная идея. Продуцент — это организм с «испорченной» регуляцией обмена. В природе он бы не выжил, проиграв конкуренцию, но в ферментёре, где у него нет конкурентов, а питание обильное, его «расточительность» — ценное свойство.
Обратная сторона: нестабильность
Поскольку перепроизводство невыгодно самой клетке, в культуре продуцента всегда есть давление отбора в пользу ревертантов — клеток, вернувших нормальную регуляцию. Они растут быстрее и постепенно вытесняют продуктивные клетки. Поэтому производственный цикл начинают с проверенной коллекционной культуры, а длительность непрерывных процессов ограничивают.
4. Производство белка
Зачем нужен микробный белок
Животноводству постоянно не хватает белка. Зерно, основа кормов, богато крахмалом, но бедно белком, и в его белке мало незаменимых аминокислот — прежде всего лизина. Традиционно корма дополняют соевым шротом, рыбной и мясокостной мукой, но их производство ограничено площадями и уловами. Микроорганизмы предлагают другой путь: белок, выращенный в ферментёре.
Белок, полученный из биомассы микроорганизмов, называют белком одноклеточных (в английской литературе — single cell protein) или кормовым белком [4]. Его преимущества:
- Высокое содержание белка: у бактерий — до 60–80 % сухой массы, у дрожжей — 40–55 %, у микроводорослей — 50–70 %; для сравнения, в зерне пшеницы — 11–14 %, в сое — около 35–40 %.
- Полноценный аминокислотный состав, богатый лизином; много витаминов группы B.
- Скорость: биомасса удваивается за часы, а не за месяцы.
- Независимость от климата и почвы: завод работает круглый год.
- Использование отходов: гидролизатов древесины и соломы, мелассы, молочной сыворотки, отходов спиртового производства, природного газа.
Сравнение «производительности»
Классическое учебное сравнение: бычок массой около 500 кг прибавляет за сутки порядка 0,4–0,5 кг белка в теле, а такая же масса быстро растущих дрожжей при непрерывном выращивании способна синтезировать за сутки сотни килограммов белка и больше. Разница объясняется не только скоростью деления, но и тем, что почти вся масса микробной культуры — «работающие» клетки, тогда как у животного большая часть корма уходит на поддержание жизни, движение и теплообразование.
На чём выращивают кормовой белок
| Сырьё | Продуцент | Комментарий |
|---|---|---|
| Гидролизаты древесины и соломы | кормовые дрожжи | в СССР работала целая гидролизная промышленность |
| Меласса, барда спиртовых заводов, сыворотка | дрожжи | использование отходов пищевой промышленности |
| Парафины нефти | дрожжи | белково-витаминный концентрат (БВК); производство в СССР было крупнейшим в мире, затем свёрнуто |
| Метанол | метилотрофные бактерии | в 1980-х в Великобритании работал завод на 1,5 тыс. м3, оказавшийся невыгодным при подешевевшей сое |
| Природный газ (метан) | метанокисляющие бактерии | сегодня такой белок производят для кормов рыб и животных |
| Глюкоза из крахмала | гриб фузариум | микопротеин — пищевой заменитель мяса |
| Свет и CO2 | хлорелла, спирулина | пищевые добавки, корма для аквакультуры |
| Водород и CO2 | водородокисляющие бактерии | новая разработка: белок «из воздуха» за счёт электроэнергии |
Ограничения
- Нуклеиновые кислоты. Быстро растущие клетки богаты РНК: у бактерий — до 15–20 % сухой массы. У человека при распаде пуринов образуется мочевая кислота; при большом потреблении микробной биомассы она накапливается, что грозит подагрой и камнями в почках. Поэтому для пищи биомассу обрабатывают, снижая содержание нуклеиновых кислот. Для сельскохозяйственных животных, у которых есть фермент, разрушающий мочевую кислоту, это менее важно.
- Клеточная стенка дрожжей и бактерий плохо переваривается; её разрушают.
- Безопасность: в биомассе не должно быть остатков сырья (например, углеводородов) и токсинов; продуцент должен быть безвредным.
- Экономика: микробный белок конкурирует с дешёвой соей и рыбной мукой; при падении цен на сою многие проекты оказались невыгодными.
Как из биомассы делают кормовой продукт
Готовую культуру нужно превратить в сыпучий, безопасный и хорошо усваиваемый продукт. Схема такова.
- Сгущение. Клетки отделяют от среды на сепараторах или выпариванием — содержание сухих веществ доводят с 2–5 % до 15–20 %.
- Плазмолиз или разрушение клеток. Нагреванием или механически разрушают клеточные стенки, иначе часть белка останется недоступной для пищеварительных ферментов животного.
- Снижение содержания нуклеиновых кислот (для пищевых целей): короткое прогревание активирует собственные рибонуклеазы клетки, они расщепляют РНК, и продукты распада вымываются.
- Сушка — чаще всего распылительная: суспензию распыляют в поток горячего воздуха, и капли мгновенно высыхают, не перегреваясь.
- Гранулирование, витаминизация, упаковка; контроль состава, влажности и микробиологической чистоты.
Готовый продукт содержит, кроме белка, витамины группы B, минеральные вещества и остатки клеточных стенок, работающие как пищевые волокна.
Микопротеин и белок будущего
Особый случай — микопротеин: мицелий гриба Fusarium venenatum, выращенный на глюкозе в непрерывной культуре. Его нити по структуре напоминают мышечные волокна, поэтому из него делают заменители мяса. Гриб нашли в 1960-х гг. при поиске организмов для пищевого белка в образце почвы из Англии; продукт на его основе продаётся с 1985 г.
Новое направление — белок, выращенный на газах. Бактерии, окисляющие водород, получают энергию из водорода (его можно получать электролизом воды) и строят клетки из CO2. Такой процесс не требует ни земли, ни сахара, ни света — только электричество, воздух и минеральные соли. Пока это дороже сои, но интерес к нему растёт, в том числе для обеспечения питанием в космосе.
5. Производство аминокислот
Зачем нужны аминокислоты
Из 20 аминокислот белков животные и человек не способны синтезировать девять — их называют незаменимыми; они должны поступать с пищей. В растительных кормах некоторых из них мало: в зерне пшеницы, кукурузы, ячменя первым «кончается» лизин, затем треонин, в бобовых — метионин. Белок корма усваивается организмом только в той мере, в какой хватает самой дефицитной аминокислоты (правило «самой короткой доски бочки»). Если добавить в корм всего несколько килограммов лизина на тонну, усвоение всего белка корма заметно растёт: животные растут быстрее, а на килограмм привеса уходит меньше корма. Кроме того, снижается выделение азота с навозом — это важно для охраны природы.
Какие аминокислоты производят и для чего
| Аминокислота | Способ получения | Применение |
|---|---|---|
| Глутаминовая кислота (глутамат натрия) | микробиологический синтез (коринебактерии) | усилитель вкуса; производство — миллионы тонн в год |
| Лизин | микробиологический синтез (коринебактерии, кишечная палочка) | добавка к кормам; миллионы тонн в год |
| Треонин, триптофан, валин | микробиологический синтез (кишечная палочка, коринебактерии) | добавки к кормам, медицина |
| Метионин | в основном химический синтез | добавка к кормам для птицы |
| Аспарагиновая кислота, фенилаланин | ферментативный и микробиологический синтез | получение подсластителя аспартама |
| Аргинин, глутамин, пролин и др. | микробиологический синтез | медицина, спортивное питание, растворы для внутривенного питания |
Глутамат натрия — соль глутаминовой кислоты, придающая пище вкус «умами» (мясного бульона). Его впервые выделил японский химик К. Икэда из морской водоросли комбу в 1908 г.; первые десятилетия его получали из гидролизата пшеничной клейковины. С конца 1950-х гг., после открытия коринебактерии, выделяющей глутаминовую кислоту [3], почти весь глутамат производят микробиологически — из сахара или мелассы [5].
Как идёт производство
Процесс типичен для микробиологического синтеза: продуцент выращивают в ферментёрах объёмом сотни кубометров на сахаре (глюкозе из крахмала, сахарозе, мелассе) с солями аммония или аммиаком как источником азота при интенсивной аэрации, постепенно подавая сахар. За двое-трое суток в культуральной жидкости накапливается более 100 г аминокислоты на литр. Затем клетки отделяют, аминокислоту выделяют ионообменной хроматографией и кристаллизацией. Для кормов лизин часто выпускают в виде гранул, содержащих и высушенную биомассу продуцента.
Чистота имеет значение
Пример того, почему очистка продукта так важна. В 1989 г. в США вспыхнула эпидемия эозинофилии-миалгии — тяжёлой болезни с мышечными болями и изменениями крови; заболели более полутора тысяч человек, десятки умерли. Её связали с пищевыми добавками триптофана одного японского производителя, который незадолго до этого изменил штамм-продуцент и упростил очистку. Точная причина до конца не установлена; подозревали примеси, образовавшиеся в новом процессе. После этого требования к чистоте аминокислот для пищи и лекарств ужесточились.
6. Производство витаминов
Витамины — вещества, нужные организму в малых количествах для работы ферментов; человек и животные их не синтезируют или синтезируют недостаточно. Многие витамины сегодня получают химически, но для ряда из них микробиологический синтез — единственный или самый выгодный путь.
Витамин B12 (кобаламин)
Самый сложный по строению витамин. Его в природе синтезируют только некоторые бактерии и археи; ни растения, ни животные, ни грибы сделать его не могут. Животные получают B12 от бактерий — у жвачных его образует микрофлора рубца, — а человек с продуктами животного происхождения. Поэтому строгим вегетарианцам нужны добавки B12. Промышленно его получают только микробиологически, с помощью бактерий Pseudomonas denitrificans и пропионовокислых бактерий; в среду добавляют соли кобальта, без которых витамин не образуется [6]. Применяют для лечения анемии, связанной с его недостатком, и в кормах.
Витамин B2 (рибофлавин)
Жёлто-оранжевое вещество, входящее в коферменты ФАД и ФМН. Природные «сверхпродуценты» — некоторые плесневые грибы, например Ashbya gossypii, паразит хлопчатника, выделяющий рибофлавин в огромных количествах. Сегодня рибофлавин почти полностью получают микробиологически — грибом ашбией и генно-инженерными штаммами сенной палочки. Переход с химического синтеза на микробиологический сократил число стадий, расход сырья и количество отходов [7]. Рибофлавин используют в кормах, как пищевой краситель (Е101) и в медицине.
Витамин C (аскорбиновая кислота)
Классический путь синтеза, предложенный Т. Рейхштейном в 1933 г., химический, но одна его стадия — окисление сорбита в сорбозу — проводится уксуснокислыми бактериями Gluconobacter: химически эту реакцию с нужной точностью провести трудно. В 1970-х гг. в Китае разработали двухстадийный микробиологический процесс, где бактерии выполняют уже две ступени; сегодня он основной. Это пример биотрансформации — сочетания химических и микробиологических стадий.
Провитамины и другие витамины
- β-каротин (провитамин A) получают из гриба Blakeslea trispora и из водоросли дуналиеллы, а также химически.
- Эргостерол дрожжей при облучении ультрафиолетом превращается в витамин D2; облучённые дрожжи и грибы — его источник.
- Витамин K2 образуют многие бактерии; богатый источник — натто.
- Пивные и пекарские дрожжи — природный источник витаминов группы B.
7. Органические кислоты и спирты
- Лимонная кислота — продукт аспергилла чёрного; самый массовый органический продукт микробиологического синтеза после этанола: более двух миллионов тонн в год. Используется как подкислитель напитков и кондитерских изделий, консервант, в моющих средствах вместо фосфатов.
- Молочная кислота — продукт молочнокислых бактерий. Кроме пищевого применения, из неё делают полимолочную кислоту — биоразлагаемый пластик для упаковки, одноразовой посуды, медицинских нитей и 3D-печати. Бактерии образуют нужную зеркальную форму кислоты, что важно для свойств пластика.
- Уксусная кислота пищевого назначения — продукт уксуснокислых бактерий.
- Глюконовая кислота — продукт окисления глюкозы аспергиллом; её соли (глюконат кальция) используют в медицине.
- Итаконовая, янтарная кислоты — сырьё для полимеров.
- Этанол — главный по объёму продукт биотехнологии: десятки миллионов тонн в год идут на топливо (в Бразилии — из сахарного тростника, в США — из кукурузы).
- Бутанол и ацетон — продукты клостридий (процесс Вейцмана); сегодня их снова изучают как биотопливо.
8. Антибиотики
Антибиотики — вещества, образуемые микроорганизмами (а также их полусинтетические производные), которые в малых концентрациях подавляют рост других микроорганизмов. В природе они помогают продуценту конкурировать за питание.
| Продуцент | Антибиотики |
|---|---|
| Плесневые грибы: пеницилл | пенициллины |
| Плесневые грибы: цефалоспориум (акремониум) | цефалоспорины |
| Актиномицеты (стрептомицеты) | стрептомицин, тетрациклины, эритромицин, ванкомицин (у родственного актиномицета), противогрибковый нистатин, противоопухолевые антибиотики |
| Бациллы | бацитрацин, грамицидин |
Антибиотики — вторичные метаболиты, поэтому их производят в периодическом режиме с подпиткой: сначала наращивают биомассу, затем удерживают культуру в состоянии медленного роста. Многие современные препараты — полусинтетические: природную основу молекулы получают микробиологически, а затем химически или ферментативно присоединяют разные боковые группы. Так из пенициллина получают ампициллин, амоксициллин и другие антибиотики с более широким спектром действия и устойчивостью к кислоте желудка.
Первым отечественным антибиотиком стал грамицидин С («советский»), выделенный Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражниковой в 1942 г. из почвенной бациллы; его применяли для лечения раневых инфекций в годы Великой Отечественной войны. Отечественный пенициллин «крустозин» получила под руководством З. В. Ермольевой в 1942–1943 гг.
Главная проблема — устойчивость бактерий к антибиотикам. Широкое и нередко неправильное применение антибиотиков в медицине и животноводстве отбирает устойчивые штаммы. Поэтому поиск новых антибиотиков и разумное их использование — одна из ключевых задач биотехнологии и медицины.
Как устроен поиск новых антибиотиков сегодня
Почвенные стрептомицеты «отдали» человеку большинство своих антибиотиков ещё в 1940–1960-х гг.: новые образцы почвы снова и снова дают уже известные вещества. Поэтому поиск ведут иначе.
- Необычные места. Морские осадки, пещеры, кишечник насекомых, антарктические почвы — там живут микроорганизмы, не попадавшие в прежние коллекции.
- Невыращиваемые микробы. Большинство почвенных бактерий не растут на обычных средах; для них придумали устройства, где клетки растут прямо в почве, отделённые от неё мембраной, получая природные вещества-сигналы.
- Поиск по генам. В прочитанных геномах находят «молчащие» кластеры генов, похожие на гены синтеза антибиотиков, и включают их, перенося в удобный продуцент.
- Доработка известных молекул. Химическая модификация позволяет обойти механизмы устойчивости бактерий.
Почему это важно: устойчивость бактерий к антибиотикам растёт, а новых классов антибиотиков за последние десятилетия появилось мало. Это одна из серьёзных проблем современной медицины, и решать её будут в том числе средствами биотехнологии.
9. Ферменты
Промышленные ферменты — один из самых быстро растущих продуктов микробиологического синтеза. Большинство из них микроорганизмы выделяют в среду, что упрощает получение.
| Фермент | Продуцент | Применение |
|---|---|---|
| Протеазы | бациллы | моющие средства, обработка кожи, сыроделие |
| Амилазы | бациллы, аспергиллы | получение патоки и глюкозы из крахмала, хлебопечение, пивоварение, производство спирта |
| Глюкозоизомераза | стрептомицеты и др. | глюкозо-фруктозный сироп |
| Целлюлазы | триходерма | текстиль (эффект «варёных» джинсов), корма, переработка растительного сырья |
| Пектиназы | аспергиллы | осветление соков и вин |
| Липазы | грибы, бактерии | моющие средства, получение жиров с заданными свойствами |
| Химозин | генно-инженерные грибы, дрожжи | сыроделие |
| Фитаза | генно-инженерные грибы | корма для свиней и птицы — высвобождает фосфор из растительных кормов |
| ДНК-полимеразы, рестриктазы, лигазы | генно-инженерная кишечная палочка | молекулярная биология, диагностика |
Ферменты для стиральных порошков — пример того, как биотехнология экономит энергию: они разрушают загрязнения при 30–40 °С, и стирать можно в холодной воде вместо кипячения.
10. Полисахариды и биополимеры
- Ксантан — слизистый полисахарид бактерии Xanthomonas campestris; загуститель для соусов, кетчупа, косметики, буровых растворов.
- Декстран — полисахарид, образуемый бактерией лейконостоком из сахарозы; его растворы (в нашей стране — препараты полиглюкин и реополиглюкин) применяют как кровезаменители при кровопотере.
- Бактериальная целлюлоза — очень чистая и прочная, используется для раневых покрытий и в косметике.
- Полигидроксиалканоаты — запасные вещества многих бактерий, накапливаемые в клетке в виде гранул; из них получают биоразлагаемые пластики.
11. Рекомбинантные белки
Отдельная группа продуктов микробиологического синтеза — белки человека и животных, которые синтезируют генно-инженерные микроорганизмы. В клетку продуцента вводят ген нужного белка, и она производит его наряду со своими белками.
- Инсулин человека — кишечная палочка или дрожжи; применяется при сахарном диабете с 1982 г.
- Соматотропин (гормон роста) — для лечения карликовости, вызванной его недостатком; раньше его выделяли из гипофиза умерших людей, что было опасно передачей прионной болезни.
- Интерфероны — противовирусные и противоопухолевые препараты.
- Вакцина против гепатита B — белок оболочки вируса, синтезируемый дрожжами.
- Ферменты для промышленности — химозин, фитаза и многие другие.
Сложные белки, которым нужны углеводные цепи (эритропоэтин, моноклональные антитела, факторы свёртывания крови), получают уже не в микроорганизмах, а в культурах клеток млекопитающих. Как конструируют таких продуцентов, разбирается в статье серии о генной инженерии.
12. Микробиологический и химический синтез: сравнение
| Признак | Микробиологический синтез | Химический синтез |
|---|---|---|
| Катализатор | ферменты живой клетки | металлы, кислоты, щёлочи |
| Условия | 20–40 °С, нормальное давление, водная среда, pH около нейтрального | часто высокие температура и давление, органические растворители |
| Сырьё | возобновляемое: сахара, крахмал, меласса, отходы | чаще нефть, газ, уголь |
| Избирательность | очень высокая; образуется одна зеркальная форма | часто смесь изомеров, нужна очистка |
| Сложность молекулы | доступны очень сложные (белки, B12, антибиотики) | сложные молекулы требуют десятков стадий |
| Скорость процесса | сутки и более | часто часы |
| Концентрация продукта | низкая, продукт выделяют из большого объёма воды | высокая |
| Риски | заражение посторонними микробами, фагами; нестабильность штамма | токсичные отходы, высокие энергозатраты |
На практике методы сочетают: часть стадий выполняют микроорганизмы или ферменты, часть — химики. Такой подход называют химико-ферментативным или полусинтетическим (витамин C, полусинтетические антибиотики, гормоны-стероиды).
13. Биотрансформация: микробы на службе химиков
Биотрансформация особенно важна в производстве лекарств-стероидов: кортизона, преднизолона, половых гормонов. Химически ввести атом кислорода в строго определённое положение стероидного скелета очень трудно — нужны десятки стадий. В начале 1950-х гг. исследователи обнаружили, что плесневый гриб ризопус за одну стадию гидроксилирует прогестерон в нужном положении. Это резко удешевило кортизон, который до того был одним из самых дорогих лекарств. Сегодня стероидные лекарства получают из растительных стеринов (сои, диоскореи) с участием нескольких микробиологических стадий.
Биотрансформацию применяют и для получения единственной нужной зеркальной формы вещества из смеси: фермент действует только на одну из форм.
14. Технологическая схема микробиологического синтеза
Общая схема производства подробно разобрана в первой статье серии; для продуктов обмена её можно уточнить.
- Штамм-продуцент из коллекции → наращивание посевного материала.
- Приготовление и стерилизация среды: источник углерода (сахар, меласса, гидролизат крахмала), азота (аммиак, соли аммония, кукурузный экстракт), минеральные соли, для B12 — соли кобальта.
- Ферментация: для аминокислот и антибиотиков — с подпиткой сахаром, аэрацией, поддержанием pH аммиаком (он одновременно служит источником азота).
- Отделение биомассы: центрифугирование, фильтрация.
- Выделение продукта: из культуральной жидкости (аминокислоты, лимонная кислота, антибиотики, ферменты) или из клеток (B12, некоторые рекомбинантные белки).
- Очистка: осаждение, экстракция, ионообменная хроматография, кристаллизация.
- Сушка, стандартизация, упаковка; переработка отходов (биомасса — на корм или удобрение).
Если продукт — сама биомасса (кормовые дрожжи), этапы выделения проще: клетки отделяют, сгущают, подвергают плазмолизу и высушивают.
15. Как развивался микробиологический синтез
- 1910–1920-е — промышленная лимонная кислота (поверхностное выращивание аспергилла); ацетон и бутанол (клостридии).
- 1940-е — пенициллин и глубинное культивирование в ферментёрах с аэрацией; стрептомицин.
- 1950-е — микробиологический синтез витамина B12; биотрансформация стероидов; глутаминовая кислота (1956–1957).
- 1960-е — лизин и другие аминокислоты; кормовые дрожжи на гидролизатах и парафинах; ферменты для моющих средств.
- 1970–1980-е — белок одноклеточных на метаноле и парафинах; иммобилизованные ферменты; глюкозо-фруктозный сироп; первые генно-инженерные продуценты белков.
- 1990-е — наши дни — генно-инженерные продуценты аминокислот, витаминов и ферментов; прочтение геномов продуцентов; синтетическая биология; биопластики; белок на метане и водороде.
В СССР в 1960–1980-х гг. была создана одна из крупнейших в мире микробиологических промышленностей; ею руководило отдельное ведомство — Главмикробиопром. Выпускались кормовые дрожжи, белково-витаминные концентраты, кормовой лизин, ферменты, антибиотики, средства защиты растений. Часть заводов после 1990-х гг. закрылась, но в последние годы в России построены новые производства аминокислот и ферментов.
16. Откуда берутся штаммы-продуценты
Путь от природного микроорганизма до промышленного штамма проходит несколько ступеней; подробно он разобран в статье серии «Доместикация и селекция» о селекции микроорганизмов.
- Поиск в природе (скрининг). Из почвы, воды, пищевых продуктов выделяют тысячи культур и проверяют, не образует ли какая-нибудь из них нужное вещество. Так были найдены первые продуценты антибиотиков, глутаминовой кислоты, лимонной кислоты.
- Мутагенез и отбор. Культуру обрабатывают ультрафиолетом или химическими мутагенами и среди множества выживших клеток ищут более продуктивные. Процедуру повторяют много раз; так выход пенициллина подняли в тысячи раз.
- Отбор на специальных средах. Среды составляют так, чтобы расти могли только клетки с нужными свойствами: например, среда с веществом, похожим на целевую аминокислоту, или среда без неё.
- Генетические методы. Слияние клеток близких штаммов, введение дополнительных копий генов, перенос генов из других организмов.
- Испытание в ферментёре. Штамм, хороший в колбе, может оказаться плохим в аппарате: сильно пенится, чувствителен к перемешиванию, требует слишком много кислорода. Поэтому кандидатов проверяют сначала в лабораторных ферментёрах на несколько литров, потом в опытных на несколько кубометров.
- Хранение. Готовый штамм лиофилизируют или замораживают, чтобы он не менялся.
Современные компании сочетают классическую селекцию с анализом геномов и направленным изменением генов. Нередко оказывается, что в классически отобранном «рекордсмене» накоплены десятки полезных мутаций, смысл которых удаётся понять только после прочтения его генома.
17. Экономика процесса: из чего складывается цена
Почему одни продукты микробиологического синтеза стоят копейки за килограмм, а другие — тысячи рублей за миллиграмм? Главных причин три.
- Концентрация продукта. Лизина в культуральной жидкости накапливается 100–150 г/л, а некоторых рекомбинантных белков — доли грамма на литр. Чем ниже концентрация, тем больше объёма нужно переработать и тем дороже выделение.
- Сложность очистки. Кормовой лизин допустимо выпускать вместе с высушенной биомассой; лекарственный белок должен быть очищен от всех посторонних белков, ДНК и следов среды, а каждая стадия очистки — это потери продукта и затраты.
- Масштаб. Чем крупнее производство, тем меньше доля постоянных затрат. Лимонную кислоту производят миллионами тонн, а редкий фермент для лабораторий — килограммами.
Практическое следствие: усилия разработчиков направлены не только на повышение продуктивности штамма, но и на то, чтобы продукт выделялся в среду (а не накапливался внутри клетки), чтобы культура не пенилась, чтобы процесс шёл при более высокой плотности клеток. Иногда дешевле не повышать выход на 10 %, а упростить одну стадию очистки.
18. Микробиологический синтез и охрана природы
У микробиологической промышленности есть и экологическая сторона — положительная и отрицательная.
Польза:
- сырьём служат возобновляемые ресурсы и отходы — солома, опилки, меласса, сыворотка;
- биоразлагаемые пластики из молочной кислоты и полигидроксиалканоатов заменяют нефтяные полимеры;
- ферменты в моющих средствах позволяют стирать при низкой температуре и заменяют фосфаты, вызывающие «цветение» водоёмов;
- фитаза в кормах высвобождает фосфор растительного сырья, и в навозе его оказывается меньше — меньше загрязнение водоёмов;
- аминокислоты в кормах снижают выделение азота животными.
Проблемы:
- производства потребляют много воды и энергии (аэрация, охлаждение, стерилизация, выпаривание);
- остаются большие объёмы отработанной культуральной жидкости и биомассы, которые нужно перерабатывать;
- выбросы в воздух могут содержать белковую пыль и клетки продуцента — она способна вызывать аллергию у людей, живущих рядом с заводом. Именно такие жалобы, наряду с сомнениями в безопасности белка из парафинов нефти, привели в конце 1980-х гг. к общественным протестам и закрытию части заводов БВК в СССР.
Отсюда требования к современному производству: замкнутые циклы по воде, тонкая очистка воздуха, использование продуцентов с безупречной репутацией и переработка всех отходов.
19. Пенициллин: как рождалась отрасль
История промышленного пенициллина — образец того, как устроено создание биотехнологического производства, поэтому её стоит разобрать подробно.
Наблюдение. В 1928 г. Александр Флеминг, вернувшись из отпуска, заметил, что на одной из чашек с посевом стафилококков выросла плесень, а вокруг неё колонии бактерий растворились. Он выделил гриб, назвал действующее вещество пенициллином, опубликовал работу — и на годы оставил её: выделить вещество в чистом виде не удавалось, оно было нестойким.
Выделение и доказательство. В 1938–1940 гг. в Оксфорде группа Говарда Флори и Эрнста Чейна (в неё входил и Норман Хитли, придумавший способ переводить пенициллин из раствора в раствор и обратно) получила препарат, которого хватило для опытов на мышах. Восьми мышам ввели смертельную дозу стрептококков; четверым, получившим пенициллин, выжили, остальные погибли. Это доказало лечебное действие.
Нехватка вещества. Первому пациенту — полицейскому с тяжёлым заражением крови — пенициллина не хватило: его выделяли даже из мочи больного, чтобы ввести повторно, но запас кончился, и пациент погиб. Стало ясно, что главная задача — не медицина, а технология: нужно производить килограммы вместо миллиграммов.
Технологический прорыв (1941–1945). В США, в лаборатории в Пеории, решили сразу несколько задач:
- нашли дешёвую среду — кукурузный экстракт, отход крахмального производства, резко повышавший выход;
- перешли от поверхностного выращивания в сосудах к глубинному — в больших ферментёрах с мешалкой и стерильной аэрацией; это и стало главным инженерным изобретением отрасли;
- нашли более продуктивный штамм (с заплесневевшей дыни) и начали улучшать его мутагенезом;
- отработали выделение и очистку, стандартизацию активности препарата.
К высадке союзников в Нормандии в 1944 г. пенициллина хватало для армии; за годы войны он спас десятки тысяч жизней. В 1945 г. Флеминг, Флори и Чейн получили Нобелевскую премию.
В СССР препарат пенициллина — «крустозин» — получила в 1942 г. группа Зинаиды Виссарионовны Ермольевой; производство разворачивали в тяжелейших условиях войны. Отечественный антибиотик грамицидин С выделили Г. Ф. Гаузе и М. Г. Бражникова.
Чему учит эта история. Открытие вещества — лишь начало; чтобы оно стало лекарством, нужны продуктивный штамм, дешёвая среда, подходящий аппарат, способ очистки и контроль качества. Именно эти пять задач решает биотехнология для любого продукта.
20. Разбор примера: производство лизина
Проследим весь путь на одном продукте.
- Зачем. Лизин — первая лимитирующая аминокислота зерновых кормов; его добавляют в комбикорма для свиней и птицы.
- Продуцент. Коринебактерия или кишечная палочка — штамм, у которого ослаблено подавление синтеза лизина его избытком и усилен вывод лизина из клетки.
- Сырьё. Глюкоза из крахмала кукурузы или пшеницы, меласса; источник азота — аммиак и соли аммония; минеральные соли; иногда витамины.
- Ферментация. Объём 100–500 м3, температура около 32 °С, pH поддерживают аммиаком, воздух подают непрерывно, сахар — порциями. 40–60 часов, титр более 100 г/л.
- Выделение. Клетки отделяют; лизин связывают на ионообменной смоле, снимают раствором, упаривают и кристаллизуют как лизина моногидрохлорид. Для кормовых целей выпускают и жидкий концентрат, и гранулы вместе с биомассой.
- Контроль. Содержание основного вещества, посторонних аминокислот, влаги, микробиологическая чистота.
- Отходы. Биомасса и упаренная жидкость идут на корм и удобрения.
Экономика: на тонну лизина расходуется около 2 т сахара, то есть выход порядка 0,5 г/г; крупный завод выпускает десятки тысяч тонн в год. В России заводы по производству кормового лизина построены в 2010-х гг. в Белгородской и Тюменской областях, что снизило зависимость от импорта.
21. Как подбирают промышленный фермент
Фермент для производства должен не просто катализировать нужную реакцию, но и выдерживать условия, в которых ему предстоит работать. Требования к нему во многом те же, что к продуценту.
| Где работает фермент | Какие свойства нужны | Где ищут |
|---|---|---|
| Стиральный порошок | активность при 30–40 °С и щелочном pH, устойчивость к поверхностно-активным веществам и отбеливателям | щелочелюбивые бациллы из содовых озёр |
| Переработка крахмала | работа при 90–105 °С | термофильные бактерии и археи горячих источников |
| ПЦР | устойчивость к многократному нагреву до 95 °С, точность копирования | термофильные бактерии и археи |
| Корма | устойчивость к кислоте желудка и к гранулированию корма при нагреве | грибы, генно-инженерные варианты |
| Производство лекарств | строгая избирательность к одной зеркальной форме | разные микроорганизмы, направленная эволюция в лаборатории |
Если природный фермент почти подходит, его «дорабатывают» направленной эволюцией: в ген вносят случайные изменения, получают тысячи вариантов белка и отбирают те, что лучше работают в нужных условиях. Это лабораторное повторение естественного отбора, только критерий задаёт человек. За развитие этого подхода Фрэнсис Арнольд получила Нобелевскую премию по химии 2018 г. [8]
22. Словарь темы
- Микробиологический синтез — получение веществ с помощью микроорганизмов в промышленных условиях.
- Продуцент — организм, образующий целевой продукт; штамм — его генетически однородная культура.
- Биомасса — масса клеток; белок одноклеточных — кормовой или пищевой белок из биомассы микроорганизмов.
- Первичные метаболиты — вещества, нужные для роста (аминокислоты, витамины, нуклеотиды, органические кислоты); вторичные — не нужные для роста (антибиотики, пигменты).
- Незаменимые аминокислоты — аминокислоты, которые организм не синтезирует и должен получать с пищей.
- Биотрансформация — превращение добавленного вещества ферментами клеток в другое вещество.
- Титр — концентрация продукта в культуральной жидкости; выход — граммы продукта на грамм субстрата; производительность — граммы на литр в час.
- Иммобилизованный фермент — фермент, закреплённый на нерастворимом носителе для многократного использования.
- Полусинтетический антибиотик — препарат, у которого природная основа молекулы получена микробиологически, а боковые группы присоединены химически.
- Рекомбинантный белок — белок, синтезируемый клеткой по введённому в неё чужому гену.
23. Витамины: кто и как их получает
Чтобы не путаться, сведём способы получения витаминов в таблицу. В ней видно, что микробиологический синтез занимает не всю область, но там, где молекула сложна, он незаменим.
| Витамин | Как получают сегодня | Продуцент или источник |
|---|---|---|
| B2 (рибофлавин) | микробиологический синтез | гриб ашбия, генно-инженерная сенная палочка |
| B12 (кобаламин) | только микробиологический синтез | псевдомонады, пропионовокислые бактерии |
| C (аскорбиновая кислота) | химический синтез с микробиологическими стадиями | глюконобактерии и другие бактерии |
| A (через β-каротин) | химический синтез; микробиологически — β-каротин | гриб блакеслея, водоросль дуналиелла |
| D2 | облучение эргостерола ультрафиолетом | дрожжи, грибы |
| E, K1, B1, B6, PP | в основном химический синтез | — |
| K2 | микробиологический синтез | сенная палочка (натто), другие бактерии |
| Биотин, фолиевая кислота | химический синтез; разрабатываются микробиологические процессы | бактерии |
Закономерность простая: чем сложнее молекула и чем важнее её пространственное строение, тем больше шансов, что промышленность доверит синтез микроорганизму.
24. Закваски, пробиотики и биопрепараты
Не всегда продукт микробиологического производства — вещество. Часто продаются сами живые микроорганизмы.
- Закваски для молочной промышленности, хлебопечения, сыроделия, силосования — концентраты живых бактерий определённых штаммов, замороженные или высушенные. Их выращивают в ферментёрах, концентрируют, смешивают с защитными веществами (сахарами, глицерином) и лиофилизируют.
- Пробиотики — препараты живых микроорганизмов (чаще бифидобактерий и лактобацилл) для восстановления микрофлоры кишечника.
- Бактериальные удобрения — препараты клубеньковых бактерий для бобовых, азотобактера, фосфатмобилизующих бактерий.
- Биологические средства защиты растений — препараты на основе бациллы тюрингской против насекомых, грибов триходермы против возбудителей болезней, вирусов насекомых.
- Препараты для очистки — смеси бактерий, разлагающих нефтепродукты, для биоремедиации; биопрепараты для септиков и компостирования.
- Силосные и кормовые добавки — дрожжи и бактерии, улучшающие пищеварение жвачных.
Главная технологическая трудность здесь — сохранить жизнеспособность клеток при сушке и хранении. Поэтому в препараты добавляют защитные вещества (трегалозу, обезжиренное молоко, глицерин), а срок годности указывают с запасом: количество живых клеток (КОЕ) постепенно снижается.
25. Генно-инженерные продуценты: что это меняет
С 1980-х гг. в промышленности всё чаще работают микроорганизмы, которым введены чужие гены или изменены собственные.
- Появились продукты, которых микроорганизмы не делали вовсе: инсулин человека, соматотропин, интерфероны, химозин телёнка, антигены вирусов для вакцин.
- Выросли выходы «старых» продуктов: современные штаммы продуцентов аминокислот и витаминов получены с участием генной инженерии.
- Сократились стадии и отходы: микробиологический рибофлавин заменил многостадийный химический синтез.
- Стало возможным переносить в удобный продуцент целые цепочки ферментов из других организмов — так дрожжи научили производить предшественник противомалярийного лекарства артемизинина, который раньше получали только из полыни.
Безопасность
Для пищевых и лекарственных продуктов действует правило: в готовом продукте не должно быть ни живых клеток продуцента, ни его ДНК в значимых количествах. Поэтому генно-инженерный химозин или фермент для хлебопечения не делает сыр и хлеб «генетически модифицированными продуктами» — это вещества, полученные с помощью ГМ-микроорганизма, но сами они химически идентичны природным. Производство ведут в закрытых системах, а отработанную биомассу обеззараживают перед утилизацией.
26. Куда движется микробиологический синтез
- Синтетическая биология. Сборка в клетке искусственных цепочек реакций из генов разных организмов, чтобы получать вещества, которые никто в природе не производит в нужных количествах.
- Сырьё без пашни. Использование метана, метанола, водорода и CO2, отходов лесной промышленности вместо сахара, чтобы не конкурировать с пищевыми культурами за землю.
- Клеточное мясо и белки-заменители. Молочные белки, яичный белок и желатин, синтезируемые дрожжами, уже продаются в ряде стран.
- Биоразлагаемые материалы. Полимеры из молочной кислоты и полигидроксиалканоатов, бактериальная целлюлоза, биопластики из отходов.
- Непрерывные и миниатюрные процессы. Автоматизированные установки, в которых тысячи вариантов штаммов испытываются параллельно в микроферментёрах объёмом в миллилитры.
- Машинное обучение в подборе штаммов. Предсказание, какие изменения генов повысят выход, по накопленным данным о множестве вариантов.
Общее направление — от «нашли в почве и улучшили мутагенезом» к «спроектировали обмен веществ под задачу». Но принципиальная основа остаётся прежней: живая клетка, растущая в ферментёре на дешёвом сырье.
27. Итог: что важно знать
- Микробиологический синтез — промышленное получение веществ с помощью микроорганизмов-продуцентов: биомассы, продуктов обмена, а также биотрансформация готовых веществ.
- Объекты: бактерии (коринебактерии, кишечная палочка, бациллы, молочнокислые, уксуснокислые, псевдомонады, стрептомицеты), дрожжи, мицелиальные грибы (пеницилл, аспергилл, ашбия), микроводоросли, генно-инженерные штаммы.
- Белок одноклеточных (кормовой белок): высокое содержание полноценного белка, быстрый рост, независимость от климата, использование отходов; ограничение — много нуклеиновых кислот.
- Аминокислоты (глутамат, лизин, треонин, триптофан) получают микробиологически: бактерии синтезируют нужную L-форму; лизин повышает усвоение белка кормов.
- Витамины: B12 — только микробиологически (бактерии); B2 — грибы и бактерии; C — химический синтез с микробиологическими стадиями; β-каротин — грибы и водоросли.
- Продуцент перепроизводит вещество потому, что у него ослаблена нормальная регуляция обмена; такие штаммы получают селекцией и генной инженерией; они нестабильны.
- Другие продукты: органические кислоты (лимонная, молочная), этанол, антибиотики, ферменты, полисахариды, рекомбинантные белки (инсулин, соматотропин, интерфероны).
- Преимущества перед химическим синтезом: мягкие условия, возобновляемое сырьё, синтез сложных молекул и нужных зеркальных форм.
28. Частые ошибки
- «Кормовой белок — это белок, выделенный из корма». Кормовой белок — биомасса микроорганизмов (или белок из неё), выращенная для корма животных.
- «Витамин B12 получают из растений». Растения B12 не синтезируют; его образуют только бактерии и археи.
- «Аминокислоты для кормов получают из мяса». Лизин, треонин, триптофан получают микробиологическим синтезом из сахаров.
- «Микробы выделяют аминокислоты, потому что они им не нужны». Аминокислоты нужны клеткам; выделяют их в больших количествах только отобранные продуценты с нарушенной регуляцией обмена.
- «Антибиотики образуют только грибы». Большинство природных антибиотиков образуют актиномицеты — бактерии; грибы дают пенициллины и цефалоспорины.
- «Лимонную кислоту получают из лимонов». Сегодня её почти всю производит аспергилл чёрный.
- «Микробиологический синтез всегда выгоднее химического». Простые молекулы (метионин, уксусная кислота для промышленности) дешевле получать химически.
- «Микробный белок можно есть без ограничений». Из-за высокого содержания нуклеиновых кислот его для пищи специально обрабатывают.
- «Инсулин производят коровы и свиньи». Сегодня инсулин человека производят генно-инженерные бактерии и дрожжи; животный инсулин почти не используется.
29. Почему это важно знать
Микробиологический синтез — не экзотика, а часть повседневной жизни. Разберём, где школьник встречается с его продуктами.
- В аптеке: антибиотики, витамины B12 и B2, инсулин, интерфероны, ферментные препараты для пищеварения, пробиотики, кровезаменители на основе декстрана.
- На кухне: лимонная кислота, пищевые кислоты и загустители, глутамат в приправах, ферменты в сыре и соках, дрожжи, закваски.
- В ванной и у стиральной машины: ферменты в порошках и средствах для посудомоечных машин.
- В магазине: продукты животноводства, выращенного на кормах с добавками аминокислот и витаминов; биоразлагаемая упаковка.
- В медицинской лаборатории: ферменты для ПЦР-диагностики, тест-системы с ферментами, питательные среды.
Понимание того, как устроено это производство, помогает трезво оценивать громкие заголовки: что значит «белок из воздуха», опасен ли «глутамат», почему нельзя просто «сделать витамин в пробирке» и почему антибиотики нельзя принимать без назначения врача.
30. Интересные факты
- Мировое производство глутамата натрия и лизина измеряется миллионами тонн в год: это крупнейшие по объёму продукты «тонкой» биотехнологии после этанола и лимонной кислоты.
- Строение витамина B12 установила в середине 1950-х гг. методом рентгеноструктурного анализа Дороти Ходжкин; за работы по строению биологически важных веществ она получила Нобелевскую премию по химии 1964 г.
- Суточная потребность человека в B12 — всего около 2–3 микрограммов, то есть грамм витамина покрыл бы потребность одного человека более чем на тысячу лет.
- Гриб Ashbya gossypii, производящий рибофлавин, поражает хлопчатник; его колонии и среда окрашиваются в ярко-жёлтый цвет из-за избытка витамина.
- В 1950-х гг. японский учёный С. Киносита просмотрел сотни бактериальных культур из почвы в поисках выделяющих аминокислоты; найденная коринебактерия до сих пор — основа отрасли.
- Добавление лизина и других аминокислот в корма позволяет снизить содержание белка в рационе свиней на несколько процентов без потери привеса, а выделение азота с навозом — на десятки процентов.
- До появления рекомбинантного соматотропина его получали из гипофиза умерших; в 1985 г. выяснилось, что так несколько пациентов заразились прионной болезнью Крейтцфельдта — Якоба. Генно-инженерный гормон полностью устранил эту опасность.
- Декстран впервые заметили как «болезнь» сахарного производства: лейконосток превращал сахарный сироп в слизистую массу, забивавшую трубы. Позже это вещество стало ценным кровезаменителем.
- Производство ферментов для стиральных порошков началось после того, как в 1960-х гг. нашли бациллы, чьи протеазы работают в щелочной среде. Сегодня почти в каждом порошке есть несколько ферментов микробного происхождения.
- В ферментёре объёмом 200 м3 помещается примерно столько же жидкости, сколько в бассейне 25 × 8 м глубиной метр; при этом вся она должна оставаться стерильной и равномерно перемешанной.
- Знаменитый лабораторный «рабочий конь» — фермент Taq-полимераза — получают сегодня не из горячих источников, а из генно-инженерной кишечной палочки, которой передали соответствующий ген.
31. Частые вопросы
Почему лизин так важен для кормов?
Лизин — незаменимая аминокислота, которой меньше всего в белке зерна. Организм строит белки только при наличии всех аминокислот; если лизина не хватает, остальные аминокислоты корма не используются для роста, а расщепляются и выводятся. Небольшая добавка лизина позволяет использовать белок корма полнее.
Почему глутамат натрия делают бактерии, а не химики?
Для вкуса нужна только L-форма глутаминовой кислоты; химический синтез даёт смесь L- и D-форм, которую надо разделять. Бактерии сразу образуют L-форму из дешёвого сахара. Это проще и дешевле.
Безопасен ли глутамат натрия?
Глутамат — обычная аминокислота, входящая в состав белков; много свободного глутамата в томатах, пармезане, грибах, соевом соусе. Организм не отличает глутамат из приправы от глутамата из пищи. Международные экспертизы признают его безопасным в обычных количествах; некоторые люди могут ощущать кратковременный дискомфорт при приёме больших доз натощак.
Почему витамин B12 не умеют делать растения и животные?
Путь синтеза B12 включает около 30 ферментативных стадий; гены этих ферментов есть только у части бактерий и архей. Растениям B12 не нужен вовсе — их ферменты работают без него. Животные используют B12, но получают его от бактерий: с пищей или от симбионтов пищеварительного тракта.
Чем микробиологический синтез отличается от брожения?
Брожение — способ получения энергии без кислорода. Микробиологический синтез — производственный процесс, в котором продукт может образовываться и при брожении (этанол, молочная кислота), и при аэробном росте (аминокислоты, лимонная кислота, антибиотики, витамины). Большинство процессов микробиологического синтеза — аэробные.
Можно ли использовать отходы для микробиологического синтеза?
Да, и это одно из главных преимуществ. Меласса, барда, сыворотка, гидролизаты соломы и древесины, отходы переработки фруктов служат сырьём для дрожжей, кормового белка, спирта, органических кислот. Так одновременно решаются две задачи — получение продукта и утилизация отходов.
Почему микробный белок до сих пор не вытеснил сою?
Себестоимость: соя растёт за счёт бесплатной энергии Солнца и азотфиксации клубеньковых бактерий, а ферментёр требует сахара или газа, кислорода, охлаждения, стерильности и электроэнергии. Микробный белок выгоден там, где есть дешёвое сырьё (газ, отходы), или где нужен продукт с особыми свойствами (корм для рыб, пищевые заменители мяса).
Что такое биотрансформация?
Превращение вещества, добавленного в среду, в другое вещество одной или несколькими реакциями, которые проводят ферменты микроорганизма. Сам микроорганизм здесь — «катализатор» одной стадии сложного химического синтеза. Примеры: окисление сорбита в сорбозу при синтезе витамина C, гидроксилирование стероидов.
Почему некоторые лекарства нельзя получить в бактериях, даже зная ген?
Бактерия прочитает ген и построит цепь аминокислот, но не сделает то, что делают клетки человека после синтеза: не присоединит углеводные цепи, не всегда правильно свернёт белок и образует дисульфидные мостики, не разрежет предшественник в нужном месте. Для таких белков (антител, эритропоэтина, факторов свёртывания крови) используют культуры клеток млекопитающих.
Что значит «титр 120 г/л» и почему это много?
Это 120 г продукта в каждом литре культуральной жидкости — почти 12 % по массе. Для сравнения, многие рекомбинантные белки накапливаются в количестве долей грамма на литр. Высокий титр означает, что из одного кубометра жидкости получают больше ста килограммов продукта, и затраты на выделение в расчёте на килограмм невелики.
Можно ли получить антибиотик химически?
Молекулы природных антибиотиков очень сложны, и полный химический синтез обычно невыгоден. Поэтому основу молекулы получают микробиологически, а затем химически или ферментативно видоизменяют — так делают полусинтетические пенициллины и цефалоспорины. Некоторые синтетические антибактериальные вещества (например, сульфаниламиды, фторхинолоны) получают химически, но антибиотиками в строгом смысле их не называют.
32. ЕГЭ
Тема относится к элементу 3.7 кодификатора [1]: «Микробиологический синтез. Объекты микробиологических технологий. Производство белка, аминокислот и витаминов». На экзамене проверяют, знает ли выпускник, что получают с помощью микроорганизмов, и может ли объяснить, почему для этого удобны именно микроорганизмы.
Что обязательно знать
- Определение микробиологического синтеза; понятия продуцент, штамм.
- Продукты: кормовой белок, аминокислоты (лизин, глутаминовая кислота), витамины (B12, B2, C), органические кислоты, антибиотики, ферменты, гормоны (инсулин).
- Объекты: бактерии, дрожжи, плесневые грибы; примеры соответствия продукта и продуцента.
- Преимущества микробиологического синтеза.
- Значение аминокислот (лизина) для кормов.
Разбор типичных формулировок
«Выберите три продукта, получаемых микробиологическим синтезом». Верные: лизин, витамин B12, кормовой белок, антибиотики, лимонная кислота, ферменты. Ловушки: «крахмал», «сахароза», «целлюлоза хлопка» — их получают из растений.
«Установите соответствие между продуктом и продуцентом». Пенициллин — пеницилл; стрептомицин — стрептомицет; лимонная кислота — аспергилл; кормовой белок — дрожжи; лизин — коринебактерия; инсулин — генно-инженерная кишечная палочка.
Часть 2: «Каковы преимущества получения кормового белка с помощью микроорганизмов?» Элементы ответа: 1) быстрый рост и высокая продуктивность; 2) высокое содержание полноценного белка, богатого незаменимыми аминокислотами, и витаминов; 3) использование дешёвого сырья и отходов; 4) производство не зависит от климата, сезона и площади земли.
Часть 2: «Почему аминокислоты получают микробиологическим, а не химическим синтезом?» Элементы: 1) микроорганизмы синтезируют только L-формы, используемые организмом; 2) химический синтез даёт смесь форм, требующую разделения; 3) микробиологический синтез идёт в мягких условиях на возобновляемом сырье.
33. Для олимпиад
Выход продукта и производительность
Производство оценивают тремя числами: титром (концентрацией продукта в конце процесса, г/л), выходом (граммов продукта на грамм сахара) и производительностью (граммов на литр в час). Все три важны: высокий титр облегчает выделение, высокий выход экономит сырьё, высокая производительность — время работы аппарата.
Пример 1. В ферментёре объёмом 200 м3 (рабочий объём 150 м3) за 60 ч накопилось 120 г/л лизина; израсходовано 36 т сахара. Масса лизина — 120 · 150 000 = 18 т; выход — 18/36 = 0,5 г/г; производительность — 120/60 = 2 г/(л·ч). За год (с учётом подготовки ≈ 100 циклов) один аппарат даст около 1,8 тыс. т лизина.
Принцип «самой короткой доски»
Пусть белок корма содержит 3 % лизина от потребности 5 %, а остальные незаменимые аминокислоты — с избытком. Тогда для синтеза белков тела используется лишь 3/5 = 60 % белка корма (по лизину); остальное сгорает. Добавка лизина до 5 % теоретически позволяет использовать почти весь белок, пока «короткой доской» не станет следующая аминокислота (обычно треонин или метионин). Так объясняется, почему в корма добавляют сразу несколько аминокислот в определённом соотношении.
Нуклеиновые кислоты в микробном белке
Пример 2. Сухая биомасса бактерий содержит 70 % белка и 15 % РНК. Рекомендуемый предел нуклеиновых кислот в рационе взрослого человека — около 2 г в сутки. Сколько белка такой биомассы человек мог бы съесть без обработки? 2 г / 0,15 ≈ 13 г биомассы в сутки — это всего около 9 г белка при потребности 50–70 г. Поэтому для пищевых целей содержание РНК снижают до 1–2 %: тогда предел — уже 100–200 г биомассы.
Почему метан — удобное сырьё для кормового белка
Метанокисляющие бактерии используют метан как источник углерода и энергии. При окислении метана энергии выделяется много, но часть углерода уходит в CO2: выход биомассы — порядка 0,6–1 г на грамм метана, против 0,5 г на грамм глюкозы у дрожжей. В расчёте на тонну сырья метан выгоднее сахара, но процесс требует очень много кислорода и охлаждения: кислорода нужно больше, чем при росте на сахаре, потому что метан — более восстановленное вещество.
Кобальт и витамин B12
Пример 3. Молекулярная масса цианокобаламина около 1355 г/моль, в молекуле один атом кобальта (59 г/моль). Сколько кобальта нужно на 1 кг витамина? 59/1355 · 1000 ≈ 44 г. Поскольку часть кобальта не усваивается, его вносят в среду с запасом. Недостаток кобальта в почвах и кормах вызывает у жвачных болезнь «сухотку»: бактерии рубца не могут синтезировать B12.
Задача на понимание: почему продуцент нестабилен
Пусть продуктивные клетки растут со скоростью μ1 = 0,30 ч−1, а мутанты, утратившие перепроизводство, — μ2 = 0,33 ч−1. В начале доля мутантов 10−6. Через сколько часов непрерывного роста она достигнет 1 %? Отношение численностей растёт как e(μ2−μ1)t = e0,03t; нужно увеличение в 104 раз: 0,03t = ln 104 ≈ 9,2; t ≈ 307 ч, около 13 суток. Даже небольшое преимущество в скорости роста быстро меняет состав культуры — поэтому процессы с продуцентами не ведут бесконечно и начинают каждый цикл с коллекционной культуры.
34. Задания с разбором
Задание 1
Что такое микробиологический синтез? Приведите четыре примера его продуктов.
Ответ
Промышленное получение веществ с помощью микроорганизмов-продуцентов. Примеры: кормовой белок, лизин, витамин B12, пенициллин, лимонная кислота, ферменты, инсулин.
Задание 2
Установите соответствие между продуктом и продуцентом: А) пенициллин; Б) лимонная кислота; В) глутаминовая кислота; Г) стрептомицин; Д) рибофлавин. Продуценты: 1) аспергилл; 2) пеницилл; 3) коринебактерия; 4) стрептомицет; 5) гриб ашбия.
Ответ
А — 2, Б — 1, В — 3, Г — 4, Д — 5.
Задание 3
Выберите три верных утверждения. 1) Витамин B12 синтезируют растения. 2) Лизин добавляют в корма, так как его мало в зерне. 3) Кормовой белок — биомасса микроорганизмов. 4) Химический синтез аминокислот даёт только L-формы. 5) Микробиологический синтез идёт в мягких условиях. 6) Антибиотики — первичные метаболиты.
Ответ
2, 3, 5.
Задание 4
Назовите не менее четырёх преимуществ получения кормового белка с помощью микроорганизмов.
Ответ
Быстрый рост; высокое содержание белка (до 60–80 % сухой массы) с полноценным набором аминокислот; витамины; использование дешёвого сырья и отходов; независимость от климата, сезона и земли; круглогодичное производство.
Задание 5
Почему добавка небольшого количества лизина в корм заметно повышает привес животных?
Ответ
Лизин — незаменимая аминокислота, которой в белке зерна меньше всего; синтез белков тела ограничен её количеством. Добавка лизина позволяет использовать для роста остальные аминокислоты корма, которые иначе расщеплялись бы.
Задание 6
Почему витамин B12 получают только микробиологическим синтезом?
Ответ
Его молекула очень сложна (более 180 атомов, кобальт), химический синтез включает десятки стадий и экономически невозможен; в природе его синтезируют только бактерии и археи.
Задание 7
Почему микробный белок для питания человека нужно специально обрабатывать?
Ответ
В быстрорастущих клетках много нуклеиновых кислот; при их распаде у человека образуется мочевая кислота, избыток которой вызывает подагру и камни в почках; поэтому содержание нуклеиновых кислот снижают; кроме того, разрушают плохо переваримые клеточные стенки.
Задание 8
Найдите ошибки и исправьте: 1) Лимонную кислоту получают из лимонов. 2) Глутамат натрия получают с помощью коринебактерий. 3) Стрептомицин образуют плесневые грибы. 4) Инсулин человека синтезируют генно-инженерные бактерии. 5) Метионин для кормов получают только микробиологически.
Ответ
1 — её получают с помощью аспергилла чёрного; 3 — стрептомицин образуют актиномицеты (стрептомицеты); 5 — метионин в основном получают химически.
Задание 9
Что такое биотрансформация? Приведите пример.
Ответ
Превращение добавленного в среду вещества в другое одной или несколькими реакциями ферментов микроорганизма. Пример: окисление сорбита в сорбозу уксуснокислыми бактериями при синтезе витамина C; гидроксилирование стероидов грибами.
Задание 10
Почему продуценты аминокислот нестабильны и их нельзя бесконечно пересевать?
Ответ
Перепроизводство невыгодно клетке; мутанты, вернувшие нормальную регуляцию, растут быстрее и вытесняют продуктивные клетки. Поэтому каждый цикл начинают с коллекционной культуры.
Задание 11
Сравните микробиологический и химический синтез по трём признакам.
Ответ
Условия: мягкие / часто высокие температура и давление. Сырьё: возобновляемое (сахара, отходы) / чаще нефтехимическое. Избирательность: одна зеркальная форма, сложные молекулы / смеси изомеров, сложные молекулы требуют многих стадий. Также: концентрация продукта ниже, риск заражения — у микробиологического.
Задание 12
Почему антибиотики производят в периодическом режиме с подпиткой, а не в непрерывной культуре?
Ответ
Антибиотики — вторичные метаболиты, образуются при замедлении роста; в непрерывной культуре клетки поддерживаются в фазе быстрого роста и к тому же накапливаются малопродуктивные мутанты.
Задание 13
Какие вещества получают с помощью аспергилла чёрного?
Ответ
Лимонную и глюконовую кислоты, ферменты (амилазы, пектиназы и др.).
Задание 14
Почему растворы декстрана используют как кровезаменитель?
Ответ
Декстран — крупный полисахарид; его растворы долго удерживаются в сосудах, создают осмотическое давление, близкое к давлению белков плазмы, и восполняют объём крови при кровопотере; он нетоксичен и постепенно выводится.
Задание 15
Установите соответствие между продуктом и группой: А) лизин; Б) пенициллин; В) рибофлавин; Г) лимонная кислота; Д) амилаза. Группы: 1) аминокислота; 2) антибиотик; 3) витамин; 4) органическая кислота; 5) фермент.
Ответ
А — 1, Б — 2, В — 3, Г — 4, Д — 5.
Задание 16
Зачем в среду для получения витамина B12 добавляют соли кобальта?
Ответ
Кобальт входит в состав молекулы B12; без него витамин не образуется.
Задание 17
Почему ферменты в стиральных порошках экономят энергию?
Ответ
Протеазы, липазы и амилазы расщепляют белковые, жировые и крахмальные загрязнения при 30–40 °С; не нужно нагревать воду до высокой температуры.
Задание 18
Почему соматотропин человека сегодня получают с помощью генно-инженерных бактерий, а не из гипофиза?
Ответ
Препарат из гипофиза умерших был дефицитным и опасным — описаны случаи заражения прионной болезнью; генно-инженерный гормон можно получать в любых количествах, он чистый и безопасный.
Задание 19 (олимпиадное)
За цикл 50 ч в 100 м3 культуральной жидкости накопилось 110 г/л глутаминовой кислоты; израсходовано 20 т глюкозы. Рассчитайте массу продукта, выход (г/г) и производительность (г/(л·ч)). Теоретический максимум выхода — около 0,82 г/г. Какую долю от него составляет полученный выход?
Ответ
Масса 110 · 100 000 л = 11 т; выход 11/20 = 0,55 г/г; производительность 110/50 = 2,2 г/(л·ч); 0,55/0,82 ≈ 0,67 — 67 % от теоретического.
Задание 20 (олимпиадное)
Сухая биомасса дрожжей содержит 50 % белка и 10 % РНК. Предел нуклеиновых кислот в пище — 2 г в сутки. Сколько граммов белка дрожжей можно съесть без обработки? До какого процента нужно снизить содержание РНК, чтобы человек мог получать из дрожжей 30 г белка в сутки?
Ответ
Без обработки: 2 / 0,10 = 20 г биомассы → 10 г белка. Для 30 г белка нужно 60 г биомассы; РНК в ней не более 2 г, то есть 2/60 ≈ 3,3 %.
Литература
- ФИПИ. Кодификатор проверяемых требований к результатам освоения основной образовательной программы и элементов содержания для проведения ЕГЭ по биологии, 2027 г. М.: ФИПИ, 2026.
- Kalinowski J., Bathe B., Bartels D. et al. The complete Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 genome sequence and its impact on the production of L-aspartate-derived amino acids and vitamins // Journal of Biotechnology. 2003. Vol. 104, № 1–3. P. 5–25. DOI: 10.1016/S0168-1656(03)00154-8.
- Kinoshita S., Udaka S., Shimono M. Studies on the amino acid fermentation. Part I. Production of L-glutamic acid by various microorganisms // The Journal of General and Applied Microbiology. 1957. Vol. 3, № 3. P. 193–205. DOI: 10.2323/jgam.3.193.
- Ritala A., Häkkinen S. T., Toivari M., Wiebe M. G. Single cell protein — state-of-the-art, industrial landscape and patents 2001–2016 // Frontiers in Microbiology. 2017. Vol. 8. Art. 2009. DOI: 10.3389/fmicb.2017.02009.
- Hermann T. Industrial production of amino acids by coryneform bacteria // Journal of Biotechnology. 2003. Vol. 104, № 1–3. P. 155–172. DOI: 10.1016/S0168-1656(03)00149-4.
- Martens J.-H., Barg H., Warren M. J., Jahn D. Microbial production of vitamin B12 // Applied Microbiology and Biotechnology. 2002. Vol. 58, № 3. P. 275–285. DOI: 10.1007/s00253-001-0902-7.
- Schwechheimer S. K., Park E. Y., Revuelta J. L., Becker J., Wittmann C. Biotechnology of riboflavin // Applied Microbiology and Biotechnology. 2016. Vol. 100, № 5. P. 2107–2119. DOI: 10.1007/s00253-015-7256-z.
- Arnold F. H. Directed evolution: bringing new chemistry to life // Angewandte Chemie International Edition. 2018. Vol. 57, № 16. P. 4143–4148. DOI: 10.1002/anie.201708408.
Обсуждение
Загружаем обсуждение…